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Ce chapitre présente deux types de relations entre l’être humain et les micro-organismes : des relations bénéfiques (microbiote) et des relations pathogènes responsables de maladies infectieuses et d’enjeux de santé publique.
Il définit un agent pathogène comme un organisme (ou entité) capable de provoquer une maladie en vivant aux dépens d’un hôte, et précise que la propagation repose sur un changement d’hôte. Les modes de transmission sont comparés : transmission directe (contact entre individus, air/eau…) et transmission vectorielle via un vecteur biologique indispensable au passage du pathogène (avec, selon les cas, maturation et/ou multiplication du pathogène dans le vecteur).
Le chapitre introduit aussi les notions de réservoir (humain ou animal, malade ou non), de porteur sain (infecté sans symptômes) et d’épidémie / endémie, afin de décrire la dynamique de propagation d’une maladie.
Enfin, il montre que la connaissance des voies de transmission permet de proposer des actions de prophylaxie (gestes d’hygiène, protection, vaccination, lutte contre les vecteurs…), et que le changement climatique peut étendre la transmission de certains pathogènes en dehors de leurs zones historiques.
Le microbiote humain est défini comme l’ensemble des micro-organismes vivant sur et dans le corps ; ses interactions avec l’hôte contribuent au maintien de la santé et peuvent être influencées par des facteurs comme l’alimentation ou certains traitements.
